女生来例假时肚子疼，医学上称为痛经，其主要原因有：

1. 激素影响：月经期间，子宫内膜脱落时会释放前列腺素，这是一种引发子宫收缩的物质，这会加剧疼痛感，尤其对于子宫后倾、腺肌症或者子宫内膜异位症的女性来说。

2. 子宫收缩：在排卵和月经期间，子宫为了帮助子宫内膜脱落而收缩，这种收缩如果不恰当地强烈，可能会导致腹痛。

3. 炎症或感染：子宫颈炎、宫颈糜烂、盆腔炎或附件炎等妇科炎症也可能引起痛经。

4. 神经敏感性：有些女性的痛阈较低，即使轻微的子宫收缩也会感到疼痛。

5. 心理因素：压力、焦虑、抑郁等心理因素也可能影响女性的月经疼痛体验。

如果痛经严重到影响日常生活，建议去医院就诊，排除其他疾病，必要时医生可能会给予药物或调整生活方式的建议。