进行肾结石手术时，对于有脑梗患者来说，确实存在一定的风险。脑梗患者可能有血管状况不佳，可能会增加手术中可能出现的低血压、血流动力学不稳定等并发症。此外，手术可能需要麻醉，而麻醉药物可能对脑梗患者的神经系统造成影响，或者手术过程中可能出现的血压波动可能对已经受损的脑组织造成进一步损害。

在进行手术前，医生会根据患者的具体情况评估手术风险，并可能采取一些措施来减少风险，比如术前进行心血管系统评估和控制，使用适当的镇痛与麻醉方式，以及监控脑功能状态。如果风险较大，医生可能会建议进行更为保守的治疗方法或术前采取必要的辅助治疗。

因此，有脑梗的患者在进行肾结石手术时，需要在医生的指导下，并充分告知医生自己的病情，以确保手术的安全性。