流产后，肚子疼和腰疼可能是由于以下几个原因：

1. 子宫收缩：人工流产后的几天内，子宫会收缩以恢复正常大小，这可能会引起轻微的疼痛，包括腰部。这是正常的恢复过程，通常会随着休息和疼痛管理而缓解。

2. 残留组织：如果流产不完全，可能会留下部分组织，这可能会导致疼痛，包括肚子疼和腰疼。这种情况需要及时就医处理。

3. 感染：流产后的感染也可能引起疼痛，包括肚子疼和腰疼。如果有发热、恶臭分泌物等症状，应立即就医。

4. 疤痕组织：如果多次流产或恢复不良，可能会形成疤痕组织，这也可能导致疼痛，特别是在腰部。

5. 精神压力：术后精神压力和焦虑也可能引起肌肉紧张，从而导致腰疼。

如果流产后疼痛持续不断、非常严重或伴有其他症状（如发热、大量出血等），应立即去医院就诊，以便医生进行检查和治疗。对于轻微疼痛，可以通过休息、热敷和适度的轻度运动来缓解。