肝内胆管结石的病因可以分为以下几个方面：

1. 胆道感染：胆道感染是肝内胆管结石最常见的病因之一。细菌感染、病毒感染、真菌感染等都可能导致胆道感染，进而形成结石。

2. 胆道梗阻：胆道梗阻也是肝内胆管结石的病因之一。胆道梗阻可能由胆道蛔虫、胆道肿瘤、胆道狭窄等引起，这些因素都可能导致胆汁滞留，形成结石。

3. 胆道结石形成：胆道结石形成是肝内胆管结石的病因之一。胆汁中的胆固醇、胆色素、钙盐等成分在胆道中沉积，形成结石。

4. 遗传因素：某些遗传性疾病，如原发性高草酸盐尿症、原发性高胆固醇血症等，可能导致胆汁成分异常，进而形成胆道结石。

5. 药物和化学物质：某些药物和化学物质可能干扰胆汁成分的正常代谢，导致胆汁成分异常，进而形成胆道结石。

6. 其他因素：其他一些因素，如肥胖、高脂饮食、饮酒等，也可能增加肝内胆管结石的风险。

总之，肝内胆管结石的病因是多方面的，包括胆道感染、胆道梗阻、胆道结石形成、遗传因素、药物和化学物质以及其他因素。了解这些病因有助于预防和治疗肝内胆管结石。