耳垂根部（也称耳垂后部或者耳后乳突区）疼痛可能是由多种原因引起的，以下是几种常见的可能性：

1. 炎症或感染：如耳后淋巴结炎，急性或慢性中耳炎，或者其他皮肤感染可能导致疼痛。

2. 耳部创伤：如果曾受到撞击或耳部受伤，可能会引发疼痛。

3. 挤压伤：耳垂根部受到挤压或拉扯，如佩戴耳环过紧或耳环脱落等，也可能导致疼痛。

4. 寄生虫感染：如在热带地区，昆虫叮咬或耳螨感染也会引起耳部不适。

5. 牙齿问题：有时候，口腔疾病如智齿发炎或者颞下颌关节疾病可能会引起耳后疼痛。

6. 疲劳或过度使用：长时间耳机使用或咀嚼口香糖过度也可能导致耳垂区域肌肉疲劳，引发疼痛。

如果耳垂根部疼痛持续或者伴随着其他症状（如红肿、听力下降、发热等），建议及时就医，以便于医生进行准确的诊断和治疗。