小孩咳嗽肚子疼可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因：

1. 呼吸道感染：常见于咳嗽，可能是由感冒或流感病毒引起的，这些疾病有时会导致腹痛，因为咳嗽引发的肌肉拉伸会牵涉到腹部。

2. 肠胃问题：咳嗽可能会占据腹部空间，使消化器官受压，尤其是对于腹泻或肠胃不适的孩子，肚子可能会疼。也可能是肠道病毒感染导致的肠胃炎或消化不良。

3. 胃食道反流：胃酸反流至食道可能导致疼痛感，并伴有咳嗽。

4. 肠绞痛：对于幼儿，肠绞痛或肠道痉挛也可能引起肚痛和咳嗽，尤其是在晚上。

5. 过敏反应：某些食物或者环境中的过敏源可能导致孩子的咳嗽和肚子疼，如哮喘等。

6. 睡眠姿势不当或压力性咳嗽：长期的侧睡可能导致胃酸反流，或是睡眠时过度刮擦喉咙，引发咳嗽和肚子不适。

如果孩子的症状持续或加重，建议及时就医，以便医生进行评估并提供适当的治疗。