小耳畸形（Microtia）的检查主要包括以下几方面：

1. 外观检查：医生会对患者进行头部的直接观察，看是否有明显的耳郭发育不良或者缺失。

2. 线影或影像学检查：如X线和CT扫描、MRI等，可以检查耳部的骨骼结构是否完整，以及中耳、内耳的发育情况。

3. 听力测试：虽然有些小耳畸形可能伴有听力问题，但听力测试可以帮助评估听力损失的程度。

4. 皮肤活检（仅在特殊情况下）：在某些类型的小耳畸形中，可能需要取皮肤样本进行活检，以确定遗传因素。

5. 指纹、足印分析：这种检查主要用于诊断遗传性小耳畸形，如called Ullrich症。

6. 遗传咨询：如果家族有小耳畸形的历史，遗传咨询是非常重要的，可以帮助家人了解遗传风险。

以上检查可能需要由耳鼻喉科医生或者整形外科医生进行，医生会根据患者的具体情况制定合适的检查方案。