绝经后卵巢囊肿大部分情况下不会自行消失，因为随着女性进入更年期，卵巢功能会逐渐衰退直至衰退，卵巢囊肿可能会因为激素水平的影响减少，但一般不会消失。绝经后卵巢囊肿的治疗应根据囊肿的性质、大小、症状以及患者的年龄和健康状况来决定。

1. 监测观察：对于小的、无症状的囊肿，医生可能会建议定期复查，以观察囊肿的变化。

2. 激素治疗：如果囊肿退行性变，可能与雌激素有关，可以考虑使用药物，如口服避孕药，来帮助缩小囊肿。

3. 药物治疗：对于某些类型，如功能性囊肿，可能需要使用药物来调整激素水平。

4. 手术治疗：如果囊肿较大、症状明显，如疼痛或者囊肿有恶变迹象，可能需要手术切除。对于绝经后的女性，腹腔镜手术通常是首选方法，因为创伤小，恢复快。

5. 保守治疗后囊肿仍未减小或症状明显，可能需要考虑病理性的卵巢囊肿，如卵巢癌等疾病，可能需要进一步的治疗。

请注意，治疗方案需要由专业的医生根据患者的具体情况制定，因此建议遵循专业医生的建议。