早上醒来眼圈疼可能是因为以下几个原因：

1. 睡眠不足：熬夜或者昨晚睡眠质量不佳，会导致眼周皮肤缺氧，形成黑眼圈。
2. 脱水：身体缺水会使皮肤显得暗淡无光，眼圈也会显得更加明显。
3. 过度疲劳：长时间工作或学习，眼睛疲劳，血液循环不畅，也会形成眼圈。
4. 遗传因素：有些人的体质会使眼周围皮肤色素沉着，形成黑眼圈。
5. 其他：如过敏反应、眼部疾病等也可能引起眼圈疼痛。

解决方法：

- 确保充足的睡眠，规律作息。

- 保持良好的饮食习惯，多喝水，补充营养。

- 注意适当的眼睛休息，比如每45分钟看电脑后闭眼休息一下。

- 使用眼霜或冷敷眼部，有助于缓解眼圈。

- 如有眼部疾病症状，建议及时就医。

如果以上方法无法缓解，且眼圈疼痛持续，建议去医院就诊，以便查明具体原因。