郑州有很多医院可以治疗卵巢囊肿，以下是一些比较知名的医院和科室，供您参考：

1. 郑州大学第一附属医院：妇科，有丰富的临床经验和较高的诊疗水平。地址：河南省郑州市商城路10号。

2. 郑州大学第三附属医院（省妇幼保健院）：妇科，专长于妇科疾病，特别是妇科肿瘤的诊治。地址：河南省郑州市东风路83号。

3. 河南省人民医院：妇科，实力强大，设备先进。地址：河南省郑州市中原区桐柏路160号。

4. 郑州大学五附院：妇科，是郑州公立大医院，诊疗水平较高。地址：河南省郑州市郑东新区商都路22号。

在选择医院时，建议您先电话咨询或在线挂号，详细了解医生的专长和预约情况，根据自身病情和需求选择适合的医院和医生。同时，切勿相信一些非正规医疗机构或广告的过度宣传。祝您早日康复！