肛瘘的最佳治疗时间并没有明确规定，但尽早治疗通常更有利于病人的康复。一旦诊断为肛瘘，通常建议在症状出现或加重后尽快就医，尤其是以下情况：

1. 肛门疼痛，排便困难或流脓液。
2. 有形成脓肿的可能，如肿块、红肿、发热等。
3. 肛瘘反复发作，长期不愈。

肛瘘的治疗有多种方法，包括药物治疗、手术治疗等，具体选择哪种方式需要根据肛瘘的类型、病情严重程度以及病人的身体状况来决定。尽早治疗可以减少病情恶化的风险，提高治愈率以及减少复发的可能性。

在选择治疗时间时，同时还应考虑到个体的差异和医生的专业建议。如果有条件，建议及早就医并跟医生详细沟通，以便获得最合适的治疗方案。