胎儿耳朵畸形，医学上称为外耳道闭锁或外耳发育不全，可能有多种原因，包括遗传因素、母体怀孕期间的环境因素、基因突变等：

1. 遗传因素：某些类型的耳朵畸形可能由遗传导致，例如父母中有耳部结构异常的人，孩子出现同样问题的风险会增加。

2. 遗传基因突变：某些基因异常可能会导致耳部结构发育缺陷，例如TBX1、GATA6等基因突变可能导致耳部结构异常。

3. 孕期母体状况：如果母体在怀孕期间遭受某些病毒感染（如风疹、巨细胞病毒等）、营养不良、接触有毒物质或某些药物，都可能增加胎儿耳朵畸形的风险。

4. 染色体异常：某些染色体异常可能导致耳朵发育缺陷，如唐氏综合症（Down syndrome）患者中就可能伴有耳部异常。

5. 胚胎发育阶段的问题：在胚胎发育过程中，如果外耳道或耳垂等结构没有按照正常顺序生长，也可能导致耳朵畸形。

需要注意的是，每个个案的具体原因可能不同，医生会根据详细的检查结果进行评估。如果发现胎儿存在耳朵畸形，应及时咨询医生，进行进一步的诊断和治疗。