耳垂内部长疙瘩并疼痛可能是由以下几种原因引起的：

1. 毛囊炎或皮脂腺炎：耳垂的皮肤腺体可能会感染或阻塞，形成一个小的红肿结节，按压时可能会疼。

2. 脂肪瘤：这是一种良性的软组织肿瘤，可能会在耳垂处形成一个可移动的肿块。

3. 皮肤囊肿：耳朵皮肤下的小囊袋可能会填充皮肤角质，形成囊肿，按压时有疼痛感。

4. 耳垢积累：耳垢堆积也可能引起耳垂不适，尤其是如果耳垢被阻塞或感染。

5. 外伤或炎症：耳朵受伤或有炎症也可能引起疼痛的疙瘩。

6. 其他疾病：如淋巴结肿大、肿瘤等情况，但比较少见，应由医生进行诊断。

如果这个疙瘩持续存在，疼痛加重，或者伴随发热、红肿等症状，建议尽快就医检查，以确定病因并进行适当的治疗。