肛门疼痛可能是由多种原因引起的，常见的包括：

1. 痔疮：痔疮是肛门周围静脉曲张形成的疾病，包括内部痔和外部痔，常常引起局部疼痛、肿胀、出血等症状。

2. 肛裂：肛裂是肛门缘皮肤或黏膜裂开，通常伴有剧烈疼痛，尤其是在排便时。

3. 肛周炎（脓肿）：由细菌感染引起的肛门周围组织炎症，表现为红肿、疼痛、发热等症状。

4. 结肠炎或直肠炎：炎症性肠病（如克罗恩病、溃疡性结肠炎）也可引起肛门疼痛，甚至肛周病变。

5. 血栓性外痔：肛门外痔静脉内血栓形成，可引起疼痛、肿胀。

6. 尖锐湿疣或疱疹：性传播疾病可能导致肛门疼痛和不适。

7. 坐骨神经痛：坐骨神经受压或炎症可能波及到肛门区域，引起疼痛。

8. 寄生虫感染：某些寄生虫疾病如蛲虫病也可能会引起肛门疼痛。

任何持续的肛门疼痛都应尽快就医，以确定病因并进行适当的治疗。