耳朵根部疼痛可能有几种原因，以下是一些常见的：

1. 外耳炎：耳朵外部炎症可能导致疼痛，尤其在游泳、耳朵进水或暴露在湿度环境中后。

2. 中耳炎：细菌或病毒感染中耳部分也可能引起耳朵根部的疼痛，可能伴有听力下降和发热。

3. 耳垢堵塞：耳垢积累可能压迫外耳道，产生不适感。

4. 毛囊炎或皮脂腺炎：这些是由于皮肤感染或毛囊堵塞引起的常见疼痛。

5. 耳道受伤或异物：如插入物品或撞击耳朵，都可能导致耳朵根部疼痛。

6. 耳朵内部结构问题：如淋巴结肿大、脂肪瘤等。

7. 神经痛：耳神经痛也可能导致耳朵根部疼痛。

如果你的症状持续不减或者伴有其他症状（如发热、耳鸣、听力减退等），建议及时就医，由专业医生进行检查和诊断。