怀孕三个月出血是一种常见的妊娠并发症，可能是由多种原因引起的。以下是一些可能导致这种症状的原因，以及相应的处理建议：

1. 胚胎着床失败：这种情况下，出血可能是胚胎没有成功在子宫内着床的结果。如果这种情况发生，通常没有疼痛感，但出血可能会持续数天。如果这种情况发生，建议咨询医生，了解是否需要终止妊娠。

2. 子宫内膜异位症：这种情况下，子宫内膜可能会在子宫外生长，导致出血。这种出血通常伴随着疼痛，并且可能发生在月经期。如果这种情况发生，建议咨询医生，进行进一步的检查和治疗。

3. 子宫颈损伤：在性行为或分娩过程中，子宫颈可能会受到损伤，导致出血。这种出血通常伴随着疼痛，并且可能发生在性行为后或分娩后。如果这种情况发生，建议咨询医生，进行进一步的检查和治疗。

4. 子宫肌瘤：子宫肌瘤是一种常见的子宫内膜增生物，可能导致出血。这种出血通常伴随着疼痛，并且可能发生在月经期。如果这种情况发生，建议咨询医生，进行进一步的检查和治疗。

总之，怀孕三个月出血可能是由多种原因引起的，建议咨询医生进行进一步的检查和治疗。医生可能会建议进行血液检查、超声检查或子宫镜检查，以确定出血的具体原因。