灰指甲，医学上称为甲真菌病，是由真菌侵犯指甲板（甲床）及其周围组织导致的疾病。灰指甲难治愈的主要原因有以下几点：

1. 真菌感染顽固：真菌不容易被清除，它会在指甲内部形成深根，导致药物难以到达感染部位，治疗周期长。

2. 指甲生长速度缓慢：与皮肤细胞的新陈代谢相比，指甲的更新速度较慢，因此治疗需要时间长。

3. 外界因素影响：如潮湿环境、公共设施（如浴室、更衣室）的交叉感染、不良的卫生习惯等，都可能导致灰指甲反复发作。

4. 个体差异：部分人可能存在免疫力低下的情况，导致对真菌的抵抗能力减弱，使得治愈更加困难。

5. 治疗方法不当：如果使用药物、手术或外用疗法不当，如剂量不足、疗程不够，可能会导致治疗失败。

6. 经常修剪指甲：过度修剪可能会破坏甲床，让真菌更容易滋生，影响治疗效果。

因此，治疗灰指甲需要坚持长期治疗，保持良好的个人卫生，避免与感染源接触，并且在医生的指导下选择合适的治疗方法。