跑步时右边肚子疼可能有多种原因：

1. 运动过度：如果你刚开始运动或者增大幅度过快，可能会导致肌肉拉伤或者过度用力，尤其是在肝脏、胆囊或者肠道部位，引发疼痛。

2. 肠胃问题：跑步期间，如果肠道受到快速的运动，可能会引起肠胃痉挛或消化不良，如肠炎、胃炎或胃溃疡等。

3. 肝脏或胆囊问题：若疼痛持续或加重，可能是肝病或胆囊疾病，如肝炎、胆结石或胆囊炎。

4. 运动不当：例如跑步姿势不正确，可能会压迫到腹部的某一器官，造成疼痛。

5. 其他原因：如肾结石、尿路感染、女性的卵巢囊肿等也可能引发疼痛。

如果你是初次出现这种情况，可以试着减慢运动速度，观察疼痛是否会减轻。如果疼痛持续或者加重，应立即停止运动，并寻求医生的建议，以排除任何可能的健康问题。