耳廓根部疼痛可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的解释：

1. 外伤或挫伤：如果你无意中撞到或拉伤了耳廓，可能会出现疼痛。

2. 皮肤感染：如果没有正确清洁或如毛囊炎、湿疹等皮肤病，可能导致局部感染。

3. 耳垢积聚：耳朵内部的耳垢不慎进入耳廓，可能造成不适，特别是如果耳垢堵住了皮肤腺或耳垢耵聍穿孔。

4. 耳部炎症：耳朵的炎症，如急性中耳炎，有时也会传递到耳廓根部。

5. 骨关节问题：像颞颌关节紊乱或者耳部软骨发育异常，也可能导致疼痛。

6. 神经问题：一些结构性问题或者神经受压（如压耳症、耳部肿瘤等）也可能引起疼痛。

如果你的疼痛持续、加重，或者伴随着其他症状如发热、耳鸣、听力下降等，应及时就医，以确定疼痛的具体原因并进行相应的治疗。