耳朵掏疼可能有以下几种原因：

1. 外耳道炎：耳朵皮肤受到细菌、真菌感染，或者耳屎积累、干燥刺激导致炎症，掏耳朵时可能会感到疼痛。

2. 手法不当：如果你使用棉签等工具掏耳朵，可能会不小心损伤到耳道，尤其是耳垢堆积得较硬时，用力过大可能会损伤耳道或耳膜，引起疼痛。

3. 耳垢堵塞：耳垢过多堵塞外耳道口，掏耳朵时可能会感到不适，甚至影响听力。

4. 皮肤过敏：对于某些人来说，可能对棉签中的某些成分过敏，掏耳朵时会有疼痛感。

5. 耳膜穿孔：严重情况下，如果用力过猛或者有其他外伤，可能会导致耳膜破裂，此时疼痛更为明显。

如果你频繁掏耳朵并感疼痛，建议尽快去医院耳鼻喉科就诊，由专业医生检查并给出治疗建议，避免自行处理导致耳朵更严重的感染或损伤。平时要注意保持耳朵清洁，使用正确的洁耳方法，避免用力过猛。