急性咽炎的治疗通常需要抗生素来对抗细菌感染，头孢类和阿莫西林都是常见的治疗急性细菌性咽炎的抗生素。选择使用哪一种药物主要取决于以下几个因素：

1. 病原体：如果通过细菌培养或快速检测确定了病原体，头孢类如果对特定的细菌有效（如肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等）可能效果更好。阿莫西林对许多革兰氏阳性菌（如链球菌）有很好的抗菌效果，包括一些普通咽炎常见的细菌。

2. 抗菌谱：头孢类抗生素的抗菌谱广，对多种细菌有作用，而阿莫西林相对针对的是更窄的菌群，但通常对急性咽炎的常见病原菌有效。

3. 抗药性：如果在社区中存在针对这些药物的抗生素耐药情况，医生可能会选择另一种药物以避免耐药性增长。

4. 个体差异：医生需要考虑病人的过敏史、药物过敏性、药物疗效、可能的副作用等因素。

在医生的指导下，根据具体情况决定使用头孢还是阿莫西林。通常在急性咽炎初期，医生可能会先给予阿莫西林或者选择一个副作用较少、易被耐受的抗生素。在使用任何药物之前，请务必按照医生的处方和建议。如果症状持续不减或者加重，请及时就诊。