无创产前基因检测（Non-Invasive Prenatal Testing，简称NIPT）是一种通过血液检测来评估胎儿染色体状况的筛查方法，主要用于检测常见的染色体异常如唐氏综合症（Down Syndrome）、爱德华氏综合症（Edward Syndrome）和帕塔森综合症（Patau Syndrome）等。这些异常导致的胎儿主要表现为智力发展障碍和身体畸形。

无创产前筛查不能排除以下所有的胎儿畸形：

1. 脊柱裂：无创检测无法检测胎儿是否有脊柱裂或其它神经管缺陷，需要通过超声检查来评估。

2. 先天性心脏病：心脏结构或功能异常通常需要通过超声心动图等更详细的检查来确定。

3. 染色体结构异常：除了特定的三体综合征（如21、18、13号染色体三体），无创检测可能无法覆盖所有染色体结构异常。

4. 其他器官缺陷：例如肝脏、肾脏、胃肠道或其他系统的发育问题，需要其他检查来发现。

5. 减数分裂异常：如染色体重排、易位、交换等，无创检测可能也无法完全排除。

6. 小部分神经管缺陷：例如面部或其他精确部位的畸形，可能需要进一步的超声检查来确认。

因此，尽管无创产前筛查在某些情况下非常有用，但它并非万能，对于某些特定的胎儿畸形，可能需要结合其它诊断方法来进行确认。建议孕妇在怀孕期间遵医嘱，进行系统性的产前检查。