细菌的基本结构主要包括以下几部分：

1. 细胞壁：细菌的最外层是细胞壁，它主要由肽聚糖（多糖-蛋白质复合物）构成，为细菌提供保护，抵抗压力和渗透压。有些细菌的细胞壁含有特殊成分，如脂多糖，是引起人类疾病的致病因素。

2. 细胞膜：细胞壁内是细胞膜，主要由脂质双层构成，有选择透过性，控制物质进出细胞。细胞膜上有许多蛋白质，如转运蛋白、通道蛋白等。

3. 细胞质：细胞膜内是充满了细胞质的区域，细胞质中含有细胞器，如核糖体（合成蛋白质的主要场所）、质粒（小型环状DNA分子，可能携带遗传信息）和某些细菌的特殊细胞器，比如在某些真细菌中有线粒体一样的结构。

4. 核区：细菌通常为原核生物，其遗传物质是环状DNA，称为拟核，位于细胞质中的核区，没有真核生物那样的典型细胞核。

5. 鞭毛（仅存在于某些细菌）：某些细菌拥有鞭毛这一运动结构，通过鞭毛可以进行鞭毛的摆动而进行移动，如大肠杆菌。

6. 菌毛（仅存在于某些细菌）：部分细菌的表面有称为菌毛的特殊结构，菌毛可以帮助细菌进行粘附和遗传物质的转移。

这些基本结构共同构成了细菌的基本形态，并保证其进行生命活动所需的机能。