蹲下低头时头疼可能与以下原因有关：

1. 压力变化：当你蹲下低头，头部位置改变，可能会导致血液流向头部减少，从而引发暂时性供血不足，引起头疼。

2. 颈部不适：长期低头看手机或电脑，可能导致颈部肌肉紧张或颈椎问题，蹲下时这些压力可能会转移到头部，引发头疼。

3. 眼睛疲劳：近距离看东西会使眼睛疲劳，如果在低头时眼睛疲劳，可能导致头疼。

4. 缺乏运动：长时间保持同一姿势，缺乏运动，可能影响血液循环和肌肉放松，也会引发头疼。

5. 其他疾病：有时头疼可能是其他健康问题，如高血压、低血糖、偏头痛等的伴随症状。

如果你经常有这种症状，建议你注意休息，保持良好的坐姿和站姿，适当运动以促进血液循环，如果头疼持续或者加重，最好咨询医生进行诊断和治疗。