胃肠镜检查时可能会有一定的不适感，但通常情况下是可以接受的。以下是一些可能出现的情况：

1. 适应过程：插入胃镜或肠镜时，可能会有一些刺痛或者轻度的胀感，这是因为内镜需要通过食道、胃或肠道。这种不适通常短暂且随着操作进行逐渐减小。

2. 麻醉或镇静：如果患者选择了局部麻醉或使用镇静药物，可能会降低不适感，但可能会有轻微的麻木或口干感。

3. 鼓励排气：在做结肠镜检查时，医生可能会要求患者短暂屏住呼吸或排便，这可能会引起一些不适。

4. 检查时的不适：有时，由于内镜观察到病灶，可能需要进行生物组织活检，这可能会伴有轻度的出血或不适感。

总的来说，大多数人都能在专业医生的指导下完成检查，而且检查后通常能获得重要的诊断信息。如果感到无法忍受或有严重不适，应立即告诉医生。如果你对检查有恐惧感或担忧，可以提前与医生进行沟通，让医生了解你的顾虑并提供相应的帮助。