掏耳朵时咳嗽可能有以下几个原因：

1. 刺激咽喉：掏耳朵时，如果工具接触到耳道或者耳垢较多，可能会刺激到耳咽管（连接耳朵和咽喉的管道），引发反射性咳嗽，这是身体自我保护的一种反应，防止异物进入呼吸道。

2. 耳垢过多：如果耳垢过多，掏耳朵过程中可能导致耳垢突然松脱，进入咽喉，刺激咽喉引发咳嗽。

3. 感染或炎症：如果耳朵有感染或炎症，掏耳朵时可能会进一步刺激，引起瘙痒或者炎症反应，导致咳嗽。

4. 不正确的工具使用：使用不干净或不合适的角度掏耳朵，可能会损伤耳道，引起不适，也可能会咳嗽。

如果掏耳朵后频繁咳嗽，伴随其他症状如耳痛、听力下降、流脓等，建议及时就医，以免延误病情。平时保持耳朵清洁，使用棉签轻轻擦拭就好，不要用尖锐的工具掏耳朵，避免耳朵受伤。