肝囊肿手术的费用会因多种因素而异，包括：

1. 手术类型：肝囊肿可能需要进行囊肿去顶减压术或囊内抽吸，两者费用不同。去顶减压术费用通常较高，因为术中可能需要切除部分囊壁。

2. 地区差异：不同地区的医疗费用会有所差异，一线城市和发达地区的费用可能会高于二线及以下城市。

3. 医院等级：公立医院和私立医院、三甲医院和普通医院的收费标准不同。

4. 患者病情：如果病情复杂，可能需要住院治疗或附加特殊检查，费用会增加。

5. 自费医保比例：医保报销比例也会影响手术费用。

根据以上因素，肝囊肿手术的费用可能在几千到数万元人民币不等，具体费用请您咨询当地医院或医保部门获取准确信息。建议在手术前详细询问医院的收费情况，并了解医保报销政策，以便做好经济准备。