新生儿出现黄疸是常见现象，可能会配合使用药物进行治疗。如果在服药过程中出现拉肚子的情况，首先应保持宝宝的水分补充，确保宝宝不脱水。以下是一些处理建议：

1. 给予充足的水分：如果拉肚子，减少固体食物，增加母乳或配方奶的喂养次数，保证宝宝充足的水分摄入。

2. 调整药物：可能需要咨询医生是否需要调整黄疸药物的剂量或者更换其他药物，因为某些药物可能会影响宝宝的肠道。

3. 纠正脱水：如果拉肚子严重或持续时间长，宝宝可能会出现脱水症状，如口干、尿少等。这时需要及时就医，可能需要补液治疗。

4. 观察宝宝状态：注意观察宝宝的精神状态、大便颜色和次数，如果有发热、呕吐、腹痛等症状，应立即就医。

5. 饮食调整：考虑换用易消化的食物，避免刺激性食物，如辛辣、油腻食物。

记住，婴儿的消化系统比较娇嫩，所以在处理药物副作用时，一定要及时咨询医生，以确保宝宝的健康。