小儿消化不良时，药物治疗应根据孩子的年龄、体重、症状轻重以及可能的原因来选择。常见的治疗药物包括：

1. 健胃消食药：如健儿消食口服液、婴儿健脾散、小儿七星茶等，这些药物通常含有山楂、麦芽、茯苓等成分，有助于促进消化。

2. 调理肠道益生菌：如妈咪爱、合生元、益生菌粉等，有助于改善肠道菌群，促进消化吸收。

3. 抗酸药物：如果消化不良是由于胃酸过多引起的，可使用抗酸药物，如蒙脱石散（保护胃黏膜）、次硝酸铋（抑制胃酸分泌）等。

4. 抗生素：在肠道感染导致消化不良时，可能需要短期使用抗生素，但必须遵循医生处方。

5. 润肠通便药：如果消化不良伴有便秘，可以使用益生元、麻油、蜂蜜水等自然方法，必要时可使用开塞露。

请记住，儿童用药需谨慎，特别是在没有医生指导的情况下，不要自行给儿童随意用药。如果消化不良持续不减或伴有其他症状（如发热、腹泻严重），应尽快就医，让医生诊断并开具适合的药物。