尿结石碎石后，即使疼痛有所减轻，也有可能会持续一段时间，尤其是在治疗初期，因为碎石过程中可能会刺激到尿道或是肾脏，导致一些炎症反应。以下是一些可能的原因：

1. 碎石未完全排出：碎石后，尿液中可能还存在一些小的结石碎片，它们可能在尿道中移动，导致疼痛感。

2. 残留结石或感染：如果碎石不够彻底，或者碎石过程中未清除所有结石，有残留的可能性，可能导致疼痛。此外，碎石后的尿路也可能受到感染，引发疼痛。

3. 尿路刺激：碎石手术可能会损伤尿道或输尿管，排尿时摩擦产生的疼痛感。

4. 炎症或水肿：手术期间可能会有炎症反应或组织水肿，导致疼痛。

如果疼痛持续且严重，或伴有发热、血尿、尿频、尿急等症状，应及时就医，以排除是否有并发症。医生可能会根据情况给出适当的治疗建议，如抗生素治疗或止痛药物。同时，保持良好的水分摄入，多饮水有助于排出碎石并减少疼痛。