治疗癫痫的专科医院有很多种，选择哪家专业主要取决于以下几个方面：

1. 医院水平：选择有较高医疗水平和丰富癫痫治疗经验的医院，如三甲医院或癫痫专科医院。通常这些医院的技术、设备和医生团队都较为专业。

2. 医生资质：医生是治疗的关键，选择有资深癫痫诊疗经验、专业技术过硬的癫痫科专家或者神经内科专家。

3. 治疗方法：现代医疗技术发展，有些医院可能提供更先进的微创手术、神经调控等治疗方式，需要根据患者的具体情况选择。

4. 服务质量：医疗服务的质量也很重要，包括挂号流程、就诊环境、咨询耐心度等。

5. 地理位置：考虑医院的地理位置是否方便，交通是否便利。

国内一些著名的癫痫专科医院有北京天坛医院、上海华山医院、广州中山大学附属第一医院等。建议你根据自身的实际情况和需求，结合网络评价、口碑、医院官网等多方面信息进行选择。同时，如果可能，可以咨询身边的朋友或亲友的建议。