月经干净后两天同房怀孕的可能性是有的，但实际上怀孕是一个复杂的过程，涉及到多个因素，包括女性的排卵时间、男性的精子数量和质量、子宫内膜的厚度和容受性等。

在月经干净后的两天内同房，如果女性的排卵时间刚好在这两天内，那么男性的精子就有可能与女性的卵子结合，从而导致怀孕。然而，这并不是一个确定的事情，因为女性的排卵时间可能会因为各种原因而变化，包括生活习惯、饮食、压力等。

此外，男性的精子数量和质量也是影响怀孕的因素。如果男性的精子数量不足或者质量不好，那么即使女性在排卵期间同房，怀孕的可能性也会降低。

最后，子宫内膜的厚度和容受性也是影响怀孕的因素。如果子宫内膜厚度不够或者容受性不好，那么即使精子和卵子结合，怀孕的可能性也会降低。

因此，尽管在月经干净后的两天内同房怀孕的可能性是有的，但这并不是一个确定的事情，还涉及到很多其他的因素。如果你担心怀孕，最好采取避孕措施，以确保自己和他人的健康和安全。