长水痘时出现头疼可能有以下几个原因：

1. 病毒感染：水痘是由水痘-带状疱疹病毒引起的，这个过程中可能会引起身体的不适，包括头疼，因为病毒感染会对神经系统产生一定程度的影响。

2. 热量调节：水痘可能导致发热，发热时身体可能会通过头部血管扩张来增加散热，这可能会引起头部不适，包括头疼。

3. 脱水：水痘可能会导致患者出汗增多，如果补充水分不足，可能会引发轻度的脱水，脱水也可能引起头疼。

4. 其他不适：患者可能因痒、疼痛或其他不适而感到压力和紧张，这也可能导致头疼。

如果头疼严重、伴随其他症状如高热、恶心、呕吐等，建议及时就医，由专业医生进行诊断并给出相应的处理措施。同时，保持良好的休息，饮食清淡，及时补充水分也有助于缓解不适。