牙龈上长肉疙瘩的情况可能是由于牙周病、口腔炎症、疱疹、口腔黏膜下纤维化、毛细血管瘤等引起的，也可能是智齿萌出或者口腔卫生不佳导致的。以下是一些可能的处理方法：

1. 温和清洁：保持口腔清洁，用软毛牙刷轻柔刷牙，避免刺激到肉疙瘩。

2. 使用漱口水：含氟漱口水可以帮助消炎和预防口腔细菌感染。

3. 饮食调整：避免辛辣、酸、硬、热的食物，以免刺激牙龈。

4. 增强体质：保持良好的生活习惯，均衡饮食，适当锻炼，提高身体免疫力。

5. 静候观察：有时候疙瘩可能是暂时的，可能随着牙龈的自然调整会消退，但如果持续存在或变大、疼痛，应及时就医。

如果肉疙瘩持续存在或者伴有疼痛、出血、影响咀嚼等症状，建议尽快到口腔科就诊，由医生进行专业的检查和治疗。可能的治疗方式包括药物治疗、手术切除等，具体要视病情而定。