儿童阴茎肿痛可能是由多种原因引起的，包括但不限于以下几种：

1. 尿路感染：儿童尿路感染可能导致尿道口红肿、疼痛，阴茎也可能肿胀。
2. 阴茎包皮炎：包皮过长或清洁不当可能导致包皮炎，引起阴茎肿胀和疼痛。
3. 幼儿时期的尿道下裂：这是一种先天性异常，可能导致尿液排出不畅，引起疼痛和肿胀。
4. 炎症性反应：比如细菌、病毒感染等，会引发炎症反应，表现为阴茎红肿和疼痛。
5. 外伤：儿童在玩耍时弄伤阴茎也可能导致肿痛。
6. 肾结石：虽然少见于儿童，但肾结石可能导致阴茎疼痛并向下延伸。

如果孩子出现阴茎肿痛的症状，家长应尽快带孩子到医院就诊，由专业医生进行检查，确定原因后给予相应的治疗。同时，保持阴茎部位清洁，避免摩擦和刺激也很重要。