怀孕三个月出现流血的情况，可能有以下几种原因：

1. 子宫颈炎症或创伤：有时，宫颈疾病或者轻微的创伤可能会引起阴道流血。
2. 子宫肌瘤或息肉：子宫内的非癌性肿瘤如肌瘤或息肉可能会在孕期导致出血。
3. 流产或宫外孕：虽然三个月是一个相对稳定的时期，但仍有可能发生早期流产或宫外孕，这需要医生的专业评估。
4. 某些感染：TORCH综合征（巨细胞病毒、风疹病毒、弓形虫和单疱病毒的感染）或某些感染性疾病也可能引起出血。
5. 荷尔蒙变化：怀孕早期或晚期，荷尔蒙水平的变化也可能导致轻度出血。

遇到这种情况，应立即联系医生或前往医院就诊，进行详细检查以确定原因，并根据医生的建议进行相应的治疗。如果是流产或严重的出血，可能需要紧急处理。在整个孕期，保持定期的产检非常重要。