腰疼并伴有褐色分泌物可能是由多种原因引起的，首先需要明确一点的是，褐色分泌物通常是来月经前或月经期的血量减少后的残留物，但也可能是其他妇科疾病的症状。以下是一些可能的原因：

1. 月经不调：如果你不在月经期间，可能是月经周期不规律或者是排卵期出血导致的。

2. 子宫内膜异位症：这种疾病会导致子宫内膜生长在子宫以外的地方，引发疼痛和异常出血。

3. 宫颈炎或宫颈息肉：这些情况可能导致宫颈糜烂，分泌物可能带褐色。

4. 子宫肌瘤：这是一种良性肿瘤，可能导致腰痛和少量出血。

5. 子宫内膜癌或宫颈癌早期：虽然罕见，但这些情况也可能引起褐色分泌物，需要及时检查。

6. 怀孕或流产：早期流产可能会有类似的表现。

7. 生殖道感染：例如宫颈炎、阴道炎等。

出现这种情况时，建议你尽快就医，通过妇科检查和必要的检验（如B超、宫颈抹片等）来确定原因，以便及时治疗。切勿忽视，以免延误病情。