激光治疗扁平疣通常是一种较为安全和有效的方法，尤其是在专业医生的指导下进行。激光治疗的主要原理是利用高能量脉冲光，精确地破坏扁平疣病毒所在的皮肤细胞，使之自然脱落，从而达到治疗目的。

激光治疗通常是无创或微创的，但也有可能留下一些疤痕，这取决于以下几个因素：

1. 个体差异：每个人的皮肤愈合能力不同，有些人可能恢复得更快，疤痕更少。
2. 治疗技术：专业的医生使用恰当的激光参数，可以减少疤痕的风险。
3. 治疗后的护理：正确的术后护理，如避免阳光直射、保持皮肤清洁干燥，也可以减少疤痕形成。
4. 治疗次数：通常需要多次治疗，如果操作得当，疤痕通常会在每次治疗后逐渐减少。

为了保证治疗效果并减少疤痕产生，建议在专业医疗机构由经验丰富的医生进行治疗，并遵循医生的术后护理建议。如果在治疗过程中有任何不适或疑虑，应立即与医生沟通。