新生儿低血糖的鉴别诊断主要考虑以下几个方面：

1. 糖尿病：某些新生儿可能有先天性胰岛素分泌过多，表现为持续的低血糖，需要与新生儿糖尿病相鉴别。

2. 脱水或饥饿：出生后喂养不及时或摄入不足，可能会短暂引起低血糖。

3. 胆红素脑病（核黄疸）：新生儿低血糖有时与黄疸同时出现，需要区别黄疸是否由高胆红素血症引起。

4. 其他疾病：如甲状腺功能低下、先天性肝脏疾病、脑部疾病（如颅内出血、脑膜炎）、消化道疾病等也可能引起低血糖。

5. 积极监测血糖：通过多次监测血糖，尤其是连续监测，有助于诊断和区分不同原因的低血糖。

为了做出准确的诊断，医生通常会结合病史、临床体征、实验室检查（如血糖、胰岛素、皮质醇等）以及必要的成像检查来判断。定期的随访和监测也很重要。