灰指甲（指甲癣）是一种常见的真菌感染，治愈灰指甲的主要原因包括：

1. 真菌感染：灰指甲是由一种名为“皮肤癣菌”的真菌引起的。真菌感染是灰指甲难以治愈的主要原因，因为真菌具有很强的生命力和耐药性。

2. 指甲结构：灰指甲感染发生在指甲的甲板层，而甲板层是指甲中最厚的一层，因此治疗灰指甲需要穿透甲板层，这增加了治疗的难度。

3. 治疗方法：灰指甲的治疗方法包括使用抗真菌药物和去除感染的甲板层。然而，治疗灰指甲通常需要较长的时间，因为真菌感染需要一段时间来清除。

4. 个人卫生：灰指甲的感染可能与个人卫生习惯有关，如不经常修剪指甲、不保持手部干燥等。因此，保持良好的个人卫生习惯可以有助于预防灰指甲的发生。

5. 耐药性：灰指甲真菌具有很强的耐药性，这可能导致治疗失败或复发。因此，选择适当的抗真菌药物和治疗方法非常重要。

总之，灰指甲难以治愈的主要原因包括真菌感染、指甲结构、治疗方法、个人卫生和耐药性。治疗灰指甲通常需要较长的时间，选择适当的治疗方法和药物，并保持良好的个人卫生习惯，可以提高治愈灰指甲的成功率。