当两岁小孩发烧达到39度时，家长需要立即采取以下应急措施：

1. 降温：用温水擦拭孩子的身体，如额头、脖子、腋下、手心和脚心等，避免使用酒精，因为酒精可能会刺激皮肤。同时，可以打开空调或电扇降低室温，但如果孩子畏寒，应避免直吹。

2. 给药：如果孩子能吞咽，可以按照医生的指示给宝宝服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚（请按药品说明书或医生建议的剂量给予）。请勿自行给孩子使用过量或未知成分的药物。

3. 补充水分：发烧可能会导致孩子食欲不振或出汗，务必让孩子多喝水，以保持体液平衡。

4. 观察症状：持续观察孩子是否有其他不适症状，如呕吐、嗜睡、抽搐等，如有异常要及时就医。

5. 寻求医生帮助：在家中处理完发烧后，如果孩子的状况没有改善，或者症状加剧，应尽快带孩子去医院就诊。

请记住，发烧通常是身体对病菌或病毒的反应，但在39度高温时，可能存在一定的风险，因此及时的处理和就医是必要的。