咳嗽时肚子疼可能有以下几个原因：

1. 肌肉紧张：咳嗽时腹肌和膈肌会强烈收缩，这可能会导致腹部肌肉紧张，从而引起疼痛感。

2. 深呼吸或咳嗽引起的牵拉：在剧烈咳嗽或深呼吸过程中，肠道可能会受到牵拉，如果肠道本身就存在问题，如炎症或消化不良，可能导致疼痛。

3. 胃肠功能紊乱：咳嗽可能影响到胃肠道的正常功能，特别是对于那些有胃食管反流病（GERD）的人来说，由于咳嗽时胃酸可能会上涌，刺激胃部或肠道，引发疼痛。

4. 肠胃疾病：如果咳嗽伴有腹痛持续存在，可能是由于肠道感染、炎症性肠病、肠道梗阻等肠胃疾病。

如果咳嗽时腹痛严重或持续不断，建议及时就医，以确定具体原因并接受适当的治疗。