输精管疼痛可能是由于多种原因引起的，其中最常见是：

1. 睾丸或输精管炎：如果输精管受到感染，可能会导致疼痛，同时可能伴有发热、尿频等症状。

2. 精索静脉曲张：这是由于精索静脉血液回流不畅，导致血管扩张，可能会引起疼痛。

3. 射精痛：精液通过输精管排出时的疼痛，可能是由于射精过程中的紧张或炎症导致的。

4. 结石：输精管结石也会引起剧烈疼痛，可能伴有血尿。

5. 神经病变：如马尾神经损伤，也可能引起尿道、会阴和下腹部疼痛。

如果你有射精时输精管疼痛的情况，建议及时就医，进行详细的检查以确定疼痛的原因，以便进行针对性的治疗。同时，保持良好的生活习惯，避免性生活过度，也有助于减轻疼痛。