妇科凝胶在使用后排出褐色物质，可能有以下几种原因：

1. 排出物中混合了旧的月经血：如果凝胶是在月经周期中间使用，尤其是用于月经不调、阴道炎等情况，可能会混淆旧的血液，导致排出物变色。

2. 使用方法不当：如果凝胶过量插入或使用不当，可能会影响到子宫内膜，使其在排出时带有一些组织碎片或凝血，呈现为褐色。

3. 药物副作用：个别凝胶可能会引起轻微出血或阴道刺激，导致排出褐色物质，通常在停止使用后会自行恢复。

4. 患有妇科疾病：如宫颈炎、宫颈糜烂、阴道炎、霉菌感染等疾病，都可能导致局部炎症反应，排出褐色物质。

5. 激素药物影响：如避孕药或激素治疗可能导致例假颜色改变，排出褐色物质。

如果排出的褐色物质持续存在，或者伴有疼痛、瘙痒、异味等症状，建议及时就医，由专业医生进行检查，以确定具体原因并给予相应治疗。