全切双眼皮手术后三个月眼部出现红肿疼痛的情况，可能有以下几种原因：

1. 感染：手术后如果没有做好伤口清洁和护理，或者接触到污染物，可能会导致感染，引起红肿和疼痛。

2. 切口愈合问题：如果愈合不良或者疤痕增生，可能会影响局部血液循环，引发炎症，造成红肿。

3. 过敏反应：有些人对手术材料、药物或自身愈合过程中产生的某些物质可能产生过敏反应，表现为红肿疼痛。

4. 手术并发症：如果手术时操作不当，也可能导致并发症，如出血、神经损伤等。

5. 炎症性疾病：某些自身免疫性疾病或眼部炎症也可能在此时出现。

如果出现这种情况，建议及时就诊，由专业医生进行检查和处理，以免延误治疗。