宝宝指甲分层可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的因素：

1. 营养不良：缺乏蛋白质、维生素A、维生素D、硒等营养素可能导致指甲变薄并分层。确保宝宝的饮食均衡，包含足够的营养。

2. 干燥或缺水：宝宝如果频繁洗手或长时间处于干燥环境中，指甲可能会变得脆弱并分层。适当保湿非常重要。

3. 指甲真菌感染：指甲真菌感染（甲沟炎或甲癣）可能导致指甲变色、分层或增厚。如果伴有红肿、疼痛等症状，应及时就医。

4. 外伤或刮擦：指甲受到挫伤、切割或者长时间摩擦，可能会导致表面分层。

5. 疾病阶段：生病期间，包括某些病毒感染（如手足口病）、营养不良、生病恢复期时，指甲也可能出现分层现象。

6. 宝宝的成长发育：随着宝宝的成长，指甲生长速度不同，新的指甲可能会覆盖在分层的旧指甲上，看起来像是分层。

如果宝宝的指甲分层持续存在或伴随其他症状，如疼痛、肿胀、变色等，建议尽快带宝宝去看医生，以便找出具体原因并进行适当的治疗。