肩膀酸痛醒来可能是由于多种原因引起的，常见的一些原因包括：

1. 睡姿不正确：如果你躺的姿势不好，比如枕头过高或过低，可能会导致肩部不适。

2. 肩部过度使用：如果你前一天做了大量肩部活动，或者进行了需要伸展肩膀的工作，可能会引发酸痛。

3. 长时间保持同一姿势：长时间看电视或使用电脑，肩膀可能会因为姿势固定而疲劳酸痛。

4. 肩部疾病：如肩周炎、肩袖损伤等，也可能会引起肩膀酸痛。

5. 肩部受凉：若夜晚睡觉时肩部受凉，也可能导致酸痛。

为了缓解肩痛，你可以试试以下方法：

1. 轻轻按摩肩部：帮助放松肌肉，缓解疼痛。
2. 热敷：用热毛巾或热水袋敷肩部，促进血液循环。
3. 适当运动：做一些肩部的拉伸运动，如旋转肩膀、耸肩等。
4. 保持良好的睡眠姿势：使用合适的枕头，避免肩部受压。
5. 如果疼痛持续不减，最好去医院检查，了解具体原因并接受专业治疗。

记住，如果肩痛伴随着其他症状，如发热、肿胀、不能正常活动等，应立即就医。