胎儿膈疝是一种罕见的胎儿期胸腔异常，主要发生在胎儿期，特征是胎儿的腹腔器官（如胃、小肠、肝脏等）通过膈肌缺陷进入到胸腔内。具体的原因尚不完全清楚，但以下几点可能与胎儿膈疝的发生有关：

1. 遗传因素：一些研究表明，胎儿膈疝可能与遗传有关，由基因突变或者染色体异常引起的。

2. 发育缺陷：胎儿生长过程中的某些发育阶段出现了失误，导致了膈肌不完全闭合，形成了缺陷。

3. 母体因素：孕期荷尔蒙水平变化、某些患有子宫内炎症的母亲或吸烟、饮酒等不良生活习惯可能增加患病风险。

4. 胎儿期生长压力：在母体子宫内的生长压力过大，也可能会使胎儿的膈肌承受不应有的压力，导致其缺陷。

5. 先天性异常：这种情况可能是由其他先天性异常同时存在，如肾上腺皮质过度增生、消化道梗阻等并发引起的。

然而，关于胎儿膈疝的确切原因，医学研究仍在进行中，以期更全面地了解导致这种状况的具体机制。