自然流产是指妊娠早期（12周以内）的胎儿自发性停止发育，导致子宫内膜脱落和排出的过程。确定自然流产是否流干净，可以通过以下几个方面进行评估：

1. 阴道出血：自然流产后，阴道出血是常见的症状之一。出血量和颜色因个体而异，通常为暗红色或鲜红色，可能伴随有恶臭。出血持续时间因个体而异，一般持续数天至数周。

2. 子宫收缩：自然流产后，子宫会出现收缩，以帮助子宫内膜脱落和排出。子宫收缩可能会引起腹痛，疼痛程度因个体而异，可能轻微或剧烈。

3. 阴道分泌物：自然流产后，阴道分泌物可能会增多，可能为褐色或粉红色，可能伴有恶臭。这些分泌物可能与子宫内膜脱落有关。

4. 妇科检查：医生可以通过妇科检查来评估子宫内膜脱落的情况。医生可能会检查阴道分泌物、子宫颈和子宫内膜的情况，以确定是否流干净了。

5. 血液检查：医生可能会建议进行血液检查，如血HCG（人绒毛膜促性腺激素）水平检查，以确定是否流产成功。

总之，确定自然流产是否流干净，需要综合考虑阴道出血、子宫收缩、阴道分泌物、妇科检查和血液检查的结果。如果所有这些指标都正常，一般可以认为自然流产已经流干净了。然而，具体的评估和治疗方案应该由专业医生根据个体情况来决定。