睡觉起来小腿疼可能有以下几个原因：

1. 睡姿不良：如果你的睡眠质量不好，长时间保持一种不自然的睡姿，如膝盖弯曲或脚部扭曲，可能会导致小腿肌肉疲劳和疼痛。

2. 过度运动：如果你前一天进行了剧烈运动，特别是在运动后没有充分拉伸，小腿肌肉可能会感到疼痛。

3. 肌肉疲劳：长时间站立或走路、长时间坐姿不良，都可能导致小腿肌肉疲劳，特别是在休息后更为明显。

4. 血液循环不畅：部分人存在下肢血液回流不畅的问题，长时间卧床不动，可能导致腿部静脉回流受阻，从而引发疼痛。

5. 腿部疾病：如静脉曲张、深静脉血栓、肌肉损伤、骨骼疾病等也可能引发小腿疼痛。

如果你经常出现这种情况，建议注意调整睡姿，避免长时间保持同一姿势，适当运动后进行拉伸，保持良好的生活习惯，并在必要时就医检查。如果疼痛持续不减或者伴随其他症状，请及时就医。